Jihlava protéká Krajem Vysočina a Jihomoravským krajem. Ústí společně se Svratkou do Novomlýnských nádrží na Dyji. Délka toku činí 184,5 km, plocha povodí je 3117 km². Na Jihlavě se nachází vodní nádrž Dalešice.
Jihlava pramení na louce nedaleko obce Jihlávka v Českomoravské vysočině. Protéká městy Jihlavou a Třebíčí. V Ivančicích přibírá své dva největší přítoky Oslavu a Rokytnou. Protéká Pohořelicemi a nakonec spolu se Svratkou ústí do novomlýnské nádrže.
Jedná se o řeku vodácky využitelnou. Jezdí se úsek řeky mezi vodní nádrží Mohelno a Hrubšicemi. Řeka je sjízdná pouze při vypouštění z přehrady. Za vysokého stavu vody lze jet i horní úsek řeky od Dolní Cerekve po Vladislav.
Tok Jihlavy je na dvou místech uměle přehrazen:
- vodní nádrž Dalešice
- vodní nádrž Mohelno
Vodní nádrže Dalešice a Mohelno tvoří zásobárnu chladicí vody pro jadernou elektrárnu Dukovany. Zároveň je mezi těmito přehradami vybudována přečerpávací vodní elektrárna Dalešice s výkonem 4×120 MW.
